Большой Барьерный риф населен разноцветными рыбками, называемыми рыбами-клоунами. Один из них, по имени Марлин, встречает трагедию. Хищная рыба пожирает свою жену Корал и почти все икры, из которых со дня на день должны были вылупиться молодые рыбы-клоуны. Маленький Немо, единственный выживший сын Марлина, становится смыслом его жизни. Однако, когда его чрезмерно опекающий отец решает отправить его в школу, случается еще одно несчастье: маленькая рыба-клоун вылавливается из океана водолазом и попадает в аквариум в офисе стоматолога в Сиднее. Марлин, хотя и страдает от страха перед открытым океаном, намеревается спасти своего сына. Его сопровождает великая забывчивая Дора.