Cariera reprezentativă Kownacki a jucat la multe niveluri reprezentative. În 2014, cu echipa națională poloneză sub 17 ani, a jucat în a doua etapă de calificare pentru Campionatul European U-17, unde a fost figura principală a echipei și a marcat trei dintre cele patru goluri ale echipei. Două goluri în meciul cu Grecia, câștigat de Polonia (2: 1), unul adăugat în meciul cu Norvegia, care s-a încheiat cu același rezultat. La 4 iunie 2015, el a fost numit la echipa națională a Poloniei pentru meciul de calificare împotriva Georgiei și amical împotriva Greciei [12]. La 9 martie 2018, el a fost numit să socializeze cu Nigeria și Coreea de Sud [13]. Pe 23 martie 2018, jucând 72 de minute într-un meci cu Nigeria, și-a făcut debutul în echipa națională a Poloniei [14]. Pe 4 iunie 2018, el a fost în echipa de 23 de membri pentru Cupa Mondială 2018 din Rusia. Pe 12 iunie 2018, într-o victorie amicală cu 4-0 împotriva Lituaniei, a marcat primul său gol în echipa națională a Poloniei.