この映画は、4つのペンギンコマンドの物語を語っています-風変わりなストラテジストのコワルスキー、爆発物のスペシャリストであるリコ、最年少で最下位のプライベート、そしてスキッパーのグループのリーダーです。ペンギンは、シークレットエージェントのホッキョクオオカミ、デトネーターのグリーンランドシール、コーポラルの筋肉のクマ、イブのスノーイーグルフクロウで構成される秘密組織ノースウィンドと戦い、邪悪なタコであることが判明した邪悪な医者オクタビウスマッキーウィッツと対峙しますデイブ。そして世界中からペンギンを破壊したいと思っています。