Joseph Morgan nació el 16 de mayo de 1981 en la ciudad de Londres, capital de Inglaterra, Reino Unido, bajo el nombre de Joseph Martin. Sin embargo, su familia se mudó rápidamente a Swansea, Gales, donde Morgan creció y comenzó sus estudios en la Morriston Comprehensive School, además de eventualmente tomar cursos de actuación en el Gorseinon College. A finales de su adolescencia, regresó a Londres para continuar su formación como actor en la Central School of Speech and Drama. En 2002, audicionó para el papel de Tom Riddle en la película Harry Potter y la cámara secreta, pero no resultó electo, y un año más tarde, debutó en el cine apareciendo en los filmes Eroica, Henry VIII y Master and Commander: The Far Side of the World. En los años siguiente, continuó desarrollando papeles recurrentes en numerosas series y películas, especialmente de BBC; grabó cinco episodios para Hex, interpretó a Filotas en Alejandro Magno ( 2004 ) y al Príncipe William en Mansfield Park (2007).
En 2011, Morgan obtuvo su primer gran papel en televisión como Niklaus «Klaus» Mikaelson, antagonista de la segunda temporada de The Vampire Diaries. El personaje tomó relevancia dentro de la historia, y pasó a formar parte del elenco principal para la tercera y cuarta temporada. Debido a la buena recepción por parte del público y la crítica, The CW realizó una serie derivada llamada The Originals, basada principalmente en la familia Mikaelson, con Klaus como principal protagonista. Su actuación en ambas series le han valido numerosas nominaciones a los Teen Choice Awards, así como una victoria en los People's Choice Awards. Además de actuar, tras su debut en The Vampire Diaries, Morgan comenzó a dirigir, realizando el cortometraje Revelation, protagonizado por Persia White, e igualmente, encargándose del episodio «Behind the Black Horizon», décimo séptimo de la tercera temporada de The Originals.
Desde mediados de 2010, Morgan es miembro activo de la fundación Positive Women, esfuerzo caritativo que busca mejorar la vida de las mujeres y niños con VIH/sida positivo en el Reino Unido y Suazilandia. Por otra parte, en 2011 comenzó una relación amorosa con Persia White, compañera de elenco de The Vampire Diaries. Ambos se comprometieron el 15 de mayo de 2014, y se casaron el 5 de julio del mismo año en Jamaica.
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