La ciudad de Basilea es la segunda economía más grande de Suiza después de la ciudad de Zúrich y tiene el PIB per cápita más alto del país, por delante de los cantones de Zug y Ginebra. Basilea es uno de los centros mundiales de la industria farmacéutica, en términos de valor, más del 94% de las exportaciones de bienes de Basilea a la ciudad se realizan en los sectores químico y farmacéutico. Bases en las instalaciones de producción ubicadas en el vecino Schweizerhalle, Basilea representa el 20% de las exportaciones suizas y genera un tercio del producto nacional bruto.
La aglomeración basiliense traspasa la frontera germano- suiza y franco- suiza, ya que engloba las ciudades de Saint-Louis y Huningue en Alsacia, así como Weil am Rhein y Lörrach en Baden-Wurtemberg. La región es conocida en alemán con el nombre de Dreiländereck (literalmente esquina de los tres países ) y en francés como District des trois frontières (distrito de las tres fronteras).
Basilea posee el último puerto para la navegación fluvial por el Rin, pues en el curso superior del río están situadas las cataratas del Rin que constituyen un gran obstáculo para la navegación.
Localizada al noroeste de Suiza a orillas del río Rin, la ciudad limita tanto con Alemania como con Francia. La región de Basilea, que culturalmente se extiende a la alemana Baden y francesa Alsacia, refleja la herencia de tres países en el nombre latino moderno: "Regio TriRhena".
La comuna limita al norte con los municipios de Huningue (FR-68) y Weil am Rhein ( DE -BW), al este con Riehen, Birsfelden (BL) y Muttenz (BL), al sur con Münchenstein (BL), Reinach (BL), Bottmingen (BL) y Binningen (BL), y al oeste con Allschwil (BL) y Saint-Louis (FR-68).
La ciudad de Basilea tiene un clima continental húmedo (clasificación climática de Köppen: Dfb).