Proteinové aminokyseliny - aminokyseliny, které tvoří proteiny, které se navzájem spojují prostřednictvím peptidové vazby. Vzhledem k poloze aminokyseliny vzhledem k karboxylové skupině patří k tzv. A-aminokyselinám, ve kterých jsou obě tyto skupiny spojeny s a atomem uhlíku molekuly aminokyseliny. S výjimkou achirálního glycinu jsou to opticky aktivní sloučeniny s L konfigurací, tj. Mající aminoskupinu na levé straně hlavního řetězce ve Fischerově projekci.
Obvykle se uvádí 20 základních (tzv. Kanonických) aminokyselin proteinu kódovaných 64 kodony. Některé zdroje rovněž poskytují: selenomethionin, selenocystein a pyrolysin. Selenocystein se translatuje do výsledného proteinu, takže se jedná o nekanonickou aminokyselinu, která není produkována posttranslačními modifikacemi. V důsledku modifikace postranních řetězců během translace se tvoří cystin, hydroxylysin a hydroxyprolin. Existuje několik obecných teorií vysvětlujících, proč těchto 20 specifických aminokyselin bylo vybráno evolucí. V případě několika aminokyselin jsou známy přesné příčiny, např. Ornithin a homoserin podléhají cyklizaci narušující strukturu hlavního řetězce, což vede k tvorbě proteinů s krátkým poločasem.
