Големият бариерен риф е обитаван от цветни риби, наречени клоун. Един от тях на име Марлин среща трагедия. Хищна риба изяжда съпругата му Корал и почти всички яйца на яйца, от които младите клоуни щяха да се излюпят всеки ден. Малкият Немо, единственият оцелял син на Марлин, става смисълът на живота му. Въпреки това, когато свръхзащитният баща реши да го изпрати на училище, настъпва друго нещастие: малък клоун се лови извън океана от водолаз и отива в аквариума в зъболекарския кабинет в Сидни. Въпреки че Марлин страда от страх от открития океан, той се замисля да спаси сина си. Той е придружен от голямата забравима Дора.