Neben dem Hauptort Rõuge umfasste die Landgemeinde bis 2017 die Dörfer Aabra, Ahitsa, Augli, Haabsilla, Haki, Hallimäe, Handimiku, Hansi, Hapsu, Heedu, Heibri, Hinu, Horsa, Hotõmäe, Hurda, Härämäe, Jaanipeebu, Jugu, Järvekülä, Järvepalu, Kadõni, Kahrila-Mustahamba (bis 2017 Mustahamba), Kahru, Kaku, Kaluka, Karaski, Karba, Kaugu, Kavõldi, Kellämäe, Kiidi, Kogrõ, Kokõ, Kokõjüri, Kokõmäe, Kolga, Kuklasõ, Kurgjärve, Kurvitsa, Kuuda, Kähri, Kängsepä, Laossaarõ, Lauri, Liivakupalu, Listaku, Lutika, Lükkä, Mikita, Muduri, Muhkamõtsa, Muna, Murdõmäe, Mõõlu, Märdi, Möldri, Nilbõ, Nogu, Nursi, Ortumäe, Paaburissa, Paeboja, Petrakuudi, Pugõstu, Pulli, Põdra, Põru, Pärlijõe, Püssä, Rasva, Raudsepä, Rebäse, Rebäsemõisa, Riitsilla, Ristemäe, Roobi, Rõuge-Matsi (bis 2017 Matsi), Ruuksu, Saarlasõ, Sadramõtsa, Saki, Sandisuu, Savioru, Sika, Sikalaanõ, Simmuli, Soekõrdsi, Soemõisa, Soomõoru, Suurõ-Ruuga, Sänna/Sännä, Tallima, Taudsa, Tialasõ, Tiidu, Tilgu, Tindi, Toodsi, Tsirgupalu, Tsutsu, Tüütsi, Udsali, Utessuu, Vadsa, Vanamõisa, Viitina, Viliksaarõ und Väiku-Ruuga.
Mit dem Zusammenschluss mit den Landgemeinden Haanja, Mõniste und einem Teil von Misso kamen 2017 die Dörfer Ala-Palo, Ala-Suhka, Ala-Tilga, Andsumäe, Haanja, Häärmäni (mit dem ehemaligen Dorf Rebäse), Haavistu, Hämkoti, Hanija, Hino, Holdi, Horoski, Horosuu, Hulaku, Hürova, Hürsi, Hüti, Ihatsi, Jaanimäe, Käänu, Kääraku, Kaaratautsa, Käbli, Kaldemäe, Kallaste, Kaloga, Kärinä, Karisöödi, Kaubi, Kergatsi, Kilomani, Kimalasõ, Kirbu, Kiviora, Koemetsa, Kõomäe, Korgõssaarõ, Kotka, Kriguli, Kuiandi, Kuklase, Külma, Kundsa, Kurõ, Kuura, Kuutsi, Laisi, Laitsna-Hurda (bis 2017 Hurda), Leoski, Lillimõisa, Loogamäe, Luutsniku, Mäe-Lüütsepä (bis 2017 Lüütsepä), Mäe-Palo, Mäe-Suhka, Mäe-Tilga, Mahtja, Mallika, Märdimiku, Mauri, Meelaku, Miilimäe, Misso, Missokülä, Misso-Saika (bis 2017 Saika), Möldre, Mõniste, Muraski, Murati, Mustahamba, Naapka, Palanumäe, Palli, Pältre, Palujüri, Parmu, Parmupalu, Pausakunnu, Pedejä, Peebu, Peedo, Piipsemäe, Pillardi, Plaani, Plaksi, Põdramõtsa (bis 2017 Pulli), Põnni, Posti, Preeksa, Pressi, Pundi, Pupli, Purka, Puspuri, Raagi, Rammuka, Resto, Ritsiko, Rogosi-Mikita (bis 2017 Mikita), Rusa, Ruusmäe, Saagri, Saagrimäe, Saika, Sakudi, Sakurgi, Saluora, Sandi, Sapi, Sarise, Saru, Savimäe, Savioja, Siksälä, Simula, Singa, Soodi, Söödi, Sormuli, Suurõsuu, Tiitsa, Tika, Tõnkova, Trolla, Tsiamäe, Tsiiruli, Tsiistre, Tsilgutaja, Tsolli, Tummelka, Tundu, Tursa, Tuuka, Uue-Saaluse, Vaalimäe, Vaarkali, Väiko-Tiilige, Vakari, Vastsekivi, Vastse-Roosa, Vihkla, Villa, Villike, Vodi (bis 2017 Kallaste), Vorstimäe, Vungi und Vänni hinzu.